گروه مهندسی مکانیک بیوسیستم در مهرماه 1383 در سطح کارشناسی رشته مهندسی مکانیک ماشینهای کشاورزی شروع به کار نمود. با توسعه گروه در سال 1390 پذیرش اولین دوره دانشجویان مقطع کارشناسی ارشد مهندسی مکانیک ماشینهای کشاورزی در گرایش طراحی و ساخت شروع شد. با تغییر نام رشته مکانیک ماشینهاي کشاورزي به مهندسی مکانیک بیوسیستم در سال تحصیلی 93-94 و ایجاد 3 گرایش طراحی ماشینهاي کشاورزي، انرژيهاي تجدیدپذیر و فناوري پس از برداشت، این گروه از مهر ماه سال 1393 در هر 3 گرایش ذکر شده در مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد دانشجو پذیرفت. همچنین در سال 1394 پذیرش اولین دوره دانشجویان رشته مهندسی ماشینهای صنایع غذایی در گروه شروع گردید.