در دوره کارشناسی در تمام دانشگاه‌های کشور تنها یک گرایش علوم و مهندسی خاک تدریس می‌شود ولی در بازنگری سرفصل دروس توسط کمیسیون برنامه ریزی آموزشی مصوب جلسه 61 سال 1394 دانشجویان رشته علوم و مهندسی خاک در مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری در یکی از دو رشته مدیریت منابع خاک و رشته مدیریت حاصلخیزی و زیست فناوری خاک ادامه تحصیل می‌دهند. هر یک از این دو رشته به گرایش‌های زیر تقسیم می‌گردد:
رشته مدیریت منابع خاک
گرایش فیزیک و حفاظت خاک
گرایش منابع خاک و ارزیابی اراضی
رشته مدیریت حاصلخیزی و زیست فناوری خاک
گرایش شیمی، حاصلخیزی و تغذیه گیاه
گرایش بیولوژی و بیوتکنولوژی خاک
هدف از ایجاد این رشته تربیت دانش‌آموختگانی است که بتوانند علاوه بر عهده‌دار شدن مسؤولیت‌های مختلف در رشته علوم و مهندسی خاک، در برنامه ریزی و آموزش علوم خاک و تحقیقات در زمینه‌های خاک‌شناسی و ایجاد برنامه‌های مناسب بهره‌وری از زمین و مدیریت پایدار، خدمات مفیدی را ارائه نمایند.